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分(fen)子间互(hu)作的(de)5大(da)实验(yan)方(fang)法:①蛋白质-蛋白质 ②蛋白质-RNA ③蛋白质-DNA ④蛋白质-DNA/RNA ⑤RNA-DNA
一(yi)、蛋(dan)白(bai)质蛋白质
免疫沉淀(IP)
免疫(yi)共(gong)沉(chen)淀(co-IP)
3.GST pull-down
和(he)GST pull-down区(qu)别(bie)
①:研究(jiu)的是体内蛋白质在自(zi)然(ran)状(zhuang)态(tai)下的相(xiang)互作用(yong),以(yi)呈(cheng)现(xian)更(geng)真(zhen)实的蛋白质相互作用。由于得(de)到(dao)的沉淀物是蛋白质复(fu)合(he)物(wu),无(wu)法判(pan)断(duan)蛋白质之(zhi)间的相互作用是(shi)直接还是间(jian)接(jie)的。
②:可(ke)以确(que)认(ren)目(mu)的蛋白和检(jian)测(ce)蛋白之间可能存(cun)在(zai)直接的相互作(zuo)用,但(dan)无法(fa)确切(qie)了解其(qi)在体内(nei)的实(shi)际结(jie)合情况(kuang);
二(er)、蛋白质(zhi)
蛋白质与(yu)RNA相互作用
①结合蛋白
结合蛋白
微(wei)小(xiao)结合蛋白(如(ru),Ago2)
②RNA
、lncRNA、circRNA、micRNA
③:以蛋白为(wei)主角(jiao),研究RNA与蛋白的互作
④:以RNA以主角为研(yan)究对(dui)象,探(tan)究其与蛋白质的相互作用
、RNA结合蛋白免疫沉淀(dian)技术(shu)(RIP)
3.RNA pull down
三(san)、蛋白质
染(ran)色(se)质免(mian)疫共沉淀技术
体(ti)内研究细(xi)胞(bao)内转录(lu)因(yin)子(zi)与启动(dong)子之间发(fa)生(sheng)相互作用的反(fan)应(ying)涉(she)及(ji)蛋白质Promoter的结合情(qing)况。
四(si)、蛋白质
凝(ning)胶迁(qian)移(yi)率(lv)实验是一种电(dian)泳(yong)实验的方式(shi)
五、荧(ying)光(guang)素(su)酶实验
启(qi)动子活(huo)性(xing)研究
基因3’UTR区和microRNA结合实验